En biologie, un trait fonctionnel est une caractéristique morphologique, physiologique, phénologique, ou comportementale d'un organisme mesurée à l'échelle des individus, affectant sa performance individuelle et considérés comme pertinent pour rendre compte de la réponse de cet organisme à son environnement ou leur effets sur les propriétés écosystémiques. Aujourd’hui, cette définition est partagée par les biologistes travaillant sur les invertébrés (aquatiques et terrestres) et les végétaux (Violle et al. 2007 ; Pey et al. 2014). En revanche, cette approche « trait » a jusqu’alors été peu employée en écologie microbienne.
Pour la première fois sur ce thème, nous allons réunir au cours de cette journée de réflexion, une trentaine de microbiologistes motivés pour travailler ensemble. Cette journée est le fruit d’une réflexion collective initiée dans le cadre du réseau TEBIS et émane d’un atelier de travail qui a pris place lors des dernières journées du réseau à Toulouse en octobre 2016.
Cette journée de réflexion démarrera par une présentation introductive sur la notion de traits. Ensuite, il s’agira de mener une réflexion commune sur la définition de trait fonctionnel en écologie microbienne. L’après-midi sera ensuite consacré à la constitution d’un premier inventaire de traits relatifs à 5-10 grandes fonctions microbiennes, il s’agira d’écrire leur définition et de décrire les méthodes d’analyses pour les mesurer. Ces fonctions (e.g. dégradation de la matière organique) ont été pré-définies par les participants avant l’organisation de cette journée de réflexion.
A l’issue de la journée, nous avons pour objectif de restituer sous forme de fiches et tableaux, les listes de traits pour ces grandes fonctions microbiennes. Ce travail servira de base à la rédaction d’un article commun présentant notre démarche originale.
